192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  60.21 
 
 
310 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  55.79 
 
 
314 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.55 
 
 
317 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.04 
 
 
307 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.04 
 
 
307 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.04 
 
 
307 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  49.15 
 
 
303 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.48 
 
 
342 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  53.82 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.88 
 
 
286 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.82 
 
 
404 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.95 
 
 
304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  46.44 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.18 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.82 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  51.72 
 
 
319 aa  242  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.59 
 
 
335 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  51.4 
 
 
328 aa  228  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  51.03 
 
 
307 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.78 
 
 
355 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.84 
 
 
310 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.49 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  40.6 
 
 
317 aa  205  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.86 
 
 
311 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.18 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.93 
 
 
300 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.95 
 
 
318 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.1 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.5 
 
 
326 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.61 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.41 
 
 
290 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.43 
 
 
288 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.69 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.74 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.89 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.22 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.79 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.22 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.64 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  28.05 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  28.57 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.7 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.54 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.66 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.42 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.72 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.51 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.24 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.92 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.53 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.28 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  27.04 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  18.09 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  24.41 
 
 
281 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.23 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.08 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.74 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0962  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.55 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.62 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.02 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.19 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  24.89 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.02 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  25.55 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.42 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.15 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3534  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.36 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  24.75 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.72 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3273  hypothetical protein  28.82 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  25.77 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.23 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1204  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.85 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00305247  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0189  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.17 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.2 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.77 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.98 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.23 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.41 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.83 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.86 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3574  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.5 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.013317  normal  0.967772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.13 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1097  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.61 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.12 
 
 
453 aa  57.4  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.59 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.73 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.45 
 
 
296 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2773  putative lipid A biosynthesis acyltransferase  24.51 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.31 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.86 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.6 
 
 
309 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  21.43 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  22.95 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>