26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3273 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3273  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.82 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.65 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.8 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.59 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.37 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  24 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.31 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  23.99 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.03 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0031  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.54 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.77 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.84 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.48 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.48 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0980  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.52 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.975069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.78 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.67 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  25.38 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.98 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.67 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.69 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.49 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>