98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3368 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 		 288 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.43 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.43 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.33 
 
 		 286 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.57 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.85 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.17 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.08 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  24.56 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.94 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.94 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.9 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.99 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  28.95 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.94 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.94 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.94 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.98 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.4 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.98 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.16 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.2 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  25.78 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.42 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.2 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.65 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.89 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.26 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.88 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.66 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.97 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.75 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.59 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.02 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.63 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.69 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.51 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.69 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  21.45 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.16 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.63 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.46 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.67 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  26.47 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.21 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.58 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.35 
 
 		 343 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.59 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  26.71 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3201  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.74 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.54 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  21.64 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.37 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  28.12 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5725  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.94 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0936  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.34 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0911  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.34 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0945  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.34 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3424  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.34 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.52 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.92 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.17 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  25.29 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.88 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.63 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.56 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.46 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.01 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.14 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.3 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.11 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  26.91 
 
 		 567 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.68 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 567 aa  45.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0730  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.05 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.19 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 585 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  23.48 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 629 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 567 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.67 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.58 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1097  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.62 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 		 573 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.47 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 		 573 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.62 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  24.06 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.83 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 572 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0658  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.87 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0642773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.21 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.86 
 
 		 317 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1696  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  31.58 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1551  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.78 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>