162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3419 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 		 342 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.86 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  51.02 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  50.34 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.49 
 
 		 307 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.49 
 
 		 307 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.49 
 
 		 307 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.26 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.72 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.23 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.27 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.64 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.71 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.22 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  44.48 
 
 		 304 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.21 
 
 		 286 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.8 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.05 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.67 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.02 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.72 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  46 
 
 		 319 aa  215  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.97 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.58 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.2 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.16 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  37.22 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.05 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.33 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  33.86 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.32 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  27.13 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.09 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.46 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  23.93 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.3 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.93 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.12 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.93 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.41 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.24 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  22.83 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.51 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.89 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.09 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.12 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.87 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.83 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.27 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.63 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  27.32 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.61 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  23.7 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 606 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  25.74 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 585 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.72 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.9 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  26.46 
 
 		 567 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.39 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.33 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 610 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.05 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 610 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3534  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.33 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.15 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  22.75 
 
 		 568 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.83 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 619 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.65 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  25.64 
 
 		 558 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 629 aa  53.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  26.9 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.68 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0962  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.4 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.39 
 
 		 343 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.77 
 
 		 313 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  31.85 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.44 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.7 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.41 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 572 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 619 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.53 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.71 
 
 		 535 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 		 567 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 		 594 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  24.82 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 619 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.23 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 623 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.46 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.7 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.41 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.65 
 
 		 320 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.08 
 
 		 295 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.47 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 572 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.13 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.605153 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>