139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3063 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
311 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.6 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.98 
 
 
404 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  44.7 
 
 
317 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.45 
 
 
310 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.12 
 
 
310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.86 
 
 
307 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  43.45 
 
 
337 aa  202  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.48 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.18 
 
 
355 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.34 
 
 
286 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.48 
 
 
326 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  43.56 
 
 
300 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  41.83 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.86 
 
 
310 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.9 
 
 
328 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.78 
 
 
307 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.24 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.56 
 
 
318 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.59 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.53 
 
 
317 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.67 
 
 
335 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.37 
 
 
292 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.39 
 
 
303 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.6 
 
 
307 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.6 
 
 
307 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.6 
 
 
307 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.61 
 
 
316 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.16 
 
 
342 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.62 
 
 
319 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.93 
 
 
234 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.54 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.33 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.58 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.9 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.22 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.42 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.06 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.8 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.65 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.86 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  27.5 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.62 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.67 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.38 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.13 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.21 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.31 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.08 
 
 
326 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.32 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.56 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.08 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.45 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.2 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  28.81 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.34 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.88 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.3 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.64 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0016  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.88 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.12 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.69 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.14 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.53 
 
 
295 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 
316 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  27.78 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.83 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.16 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.09 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.07 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.43 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.67 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.02 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.11 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.54 
 
 
306 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00120  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.94 
 
 
295 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0011  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.94 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.83 
 
 
297 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.81 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.38 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.27 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.35 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  22.78 
 
 
281 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  22.78 
 
 
281 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.76 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.64 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.11 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.76 
 
 
325 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.25 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.25 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0012  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.33 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360143  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  21.51 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.14 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0199  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.53 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2032  lauroyl/myristoyl acyltransferase-like  26.72 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346077  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  16.84 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
573 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.76 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
573 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>