49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2032 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2032  lauroyl/myristoyl acyltransferase-like  100 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.346077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.04 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0308  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.04 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  26.74 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.56 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.57 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.07 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.7 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2805  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  35.14 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0031  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.33 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3838  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.64 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.64 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1693  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.5 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.77 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.97 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.22 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.182003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1251  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.9 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1266  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.9 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2218  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.9 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.72 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1222  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.9 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.307786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.23 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2034  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.32 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1232  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.23 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.109491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0430  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.23 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.06 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0361  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.23 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.81 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.96 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2726  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.7 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  0.0936253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2523  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.42 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.226322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.04 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.07 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.76 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.34 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.83 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.37 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  30 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.78 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4425  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  24.86 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00123056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.05 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.78 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0800  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.52 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.66 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00650  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.2 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  24.34 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1572  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  32.11 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.811424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>