More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3689 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  78.46 
 
 		 567 aa  912    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 573 aa  1173    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  74.25 
 
 		 593 aa  857    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  76.9 
 
 		 575 aa  894    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  77.39 
 
 		 575 aa  889    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  70.28 
 
 		 568 aa  799    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 573 aa  1173    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  69.93 
 
 		 568 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.21 
 
 		 594 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  48.21 
 
 		 610 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  47.86 
 
 		 606 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  47.68 
 
 		 610 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  48.49 
 
 		 572 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  46.62 
 
 		 568 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  46.37 
 
 		 619 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  46.83 
 
 		 619 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  46.02 
 
 		 629 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  45.47 
 
 		 585 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  45.88 
 
 		 623 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 		 619 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.71 
 
 		 552 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 572 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  46.44 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  45.02 
 
 		 563 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  44.13 
 
 		 606 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  45.62 
 
 		 567 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  45.9 
 
 		 563 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  45.04 
 
 		 558 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  46.98 
 
 		 571 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.26 
 
 		 535 aa  319  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 		 536 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  57.45 
 
 		 256 aa  270  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  56.15 
 
 		 244 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.47 
 
 		 244 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  50.61 
 
 		 250 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  53.33 
 
 		 244 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  43.37 
 
 		 315 aa  243  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.51 
 
 		 343 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  43 
 
 		 315 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  42.33 
 
 		 315 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.62 
 
 		 324 aa  220  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.52 
 
 		 242 aa  219  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  48.26 
 
 		 252 aa  213  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.33 
 
 		 313 aa  212  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  42.45 
 
 		 259 aa  183  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  33.44 
 
 		 306 aa  178  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  41.6 
 
 		 262 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 		 255 aa  171  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 		 268 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  40.39 
 
 		 268 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  42.79 
 
 		 253 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  42.79 
 
 		 253 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.1 
 
 		 299 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  42.56 
 
 		 257 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  42.73 
 
 		 257 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 		 258 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 		 258 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.74 
 
 		 314 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 260 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 		 266 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 		 260 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 		 252 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.79 
 
 		 326 aa  157  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  42.24 
 
 		 260 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  33.11 
 
 		 324 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  36.04 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.97 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.91 
 
 		 304 aa  153  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 		 270 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  42.28 
 
 		 256 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  30.19 
 
 		 323 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  33.44 
 
 		 315 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  31.82 
 
 		 326 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  41.87 
 
 		 256 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  31.82 
 
 		 326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  32.24 
 
 		 301 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  30.92 
 
 		 324 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  31.93 
 
 		 282 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  30.26 
 
 		 324 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  31.6 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  32.38 
 
 		 320 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  35.26 
 
 		 321 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.92 
 
 		 320 aa  135  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  29.81 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  32.5 
 
 		 332 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.7 
 
 		 320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  29.93 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  29.93 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  29.7 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  35.86 
 
 		 389 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 234 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  31.67 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  26.32 
 
 		 290 aa  113  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  30.9 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 399 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.35 
 
 		 296 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>