86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3299 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  100 
 
 		 334 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  70.36 
 
 		 326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  60.06 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  61.31 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  61.07 
 
 		 301 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  59.87 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  60.07 
 
 		 324 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  61.39 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  61.39 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  61.06 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  54.69 
 
 		 306 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  60.53 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  56.29 
 
 		 282 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  54.4 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  53.97 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  57.1 
 
 		 320 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  57.76 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  52.67 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  50.94 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.57 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  41.77 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  36.36 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  36.25 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  36.03 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.97 
 
 		 552 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  29.35 
 
 		 563 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 		 572 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 572 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 619 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  27.78 
 
 		 568 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 606 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 619 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.12 
 
 		 594 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 610 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 610 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 619 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 606 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 629 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 567 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 		 623 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 567 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  32.04 
 
 		 567 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 585 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 575 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.87 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 568 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 573 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 573 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  30.56 
 
 		 575 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.8 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  28.71 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  29.84 
 
 		 558 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.1 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 571 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  28.2 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 593 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 563 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  28.1 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  26.77 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.84 
 
 		 296 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.25 
 
 		 536 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  27.54 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.33 
 
 		 535 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.73 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.08 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  23.61 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.25 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.24 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.17 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.05 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.42 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.9 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  26.81 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.9 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.05 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.4 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.73 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.81 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  24.28 
 
 		 297 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  25 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.87 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.44 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.65 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.2 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>