93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0066 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 		 314 aa  640    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  57.09 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  53.51 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  53.97 
 
 		 334 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  55.25 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  55.22 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  55.22 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  49.84 
 
 		 323 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  54.37 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  53.44 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  55.89 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  55.89 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  52.85 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.94 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  50.99 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  54.43 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  50.34 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  46.79 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  52.19 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.6 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  44.62 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  40.13 
 
 		 326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  39.8 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  41.16 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  33.54 
 
 		 567 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 		 573 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 		 573 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 		 585 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 606 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 606 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.15 
 
 		 594 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 610 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 629 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 619 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 610 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 572 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 		 619 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 623 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.65 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 619 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 568 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.7 
 
 		 552 aa  153  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  32.59 
 
 		 575 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 568 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 		 575 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  29.17 
 
 		 563 aa  152  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 572 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 		 567 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 567 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  32.17 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  27.1 
 
 		 568 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.44 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 593 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  29.74 
 
 		 558 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.95 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  32.28 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  32.38 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 563 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 		 571 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.65 
 
 		 536 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  28.01 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.81 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.3 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.84 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.41 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  26.28 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.79 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.56 
 
 		 535 aa  93.6  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.17 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.49 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.57 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.91 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  26.75 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.92 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  25.66 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.91 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.17 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.62 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.19 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.34 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.95 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.79 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  26.34 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.77 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.56 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.27 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.21 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.4 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.51 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  19.25 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.54 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.32 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  23.16 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>