88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03733 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
324 aa  660    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  70.85 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  70.53 
 
 
326 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.46 
 
 
299 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.3 
 
 
314 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  40.4 
 
 
315 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  43.23 
 
 
321 aa  202  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  40.54 
 
 
310 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  38.46 
 
 
324 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  39.53 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  38.46 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  37.63 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  35.83 
 
 
323 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  39.39 
 
 
323 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  39.53 
 
 
320 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.39 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.05 
 
 
326 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.85 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  37.5 
 
 
327 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  37.5 
 
 
327 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  37.92 
 
 
327 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  36.17 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  36.25 
 
 
334 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
606 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
585 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
606 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
610 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.54 
 
 
594 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
610 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  34.77 
 
 
567 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
572 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
629 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  30.74 
 
 
563 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
623 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
619 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
619 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
568 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
567 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
568 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 
573 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 
573 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
619 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.81 
 
 
343 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
567 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
575 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  32.47 
 
 
575 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
572 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.35 
 
 
552 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  28.25 
 
 
568 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
593 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  35.28 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  31.8 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.35 
 
 
313 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  30.62 
 
 
558 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  29.97 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  30.29 
 
 
315 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
571 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
563 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  28.44 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.15 
 
 
292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.39 
 
 
324 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.42 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.08 
 
 
296 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.67 
 
 
299 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.93 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  25.28 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.28 
 
 
536 aa  91.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.09 
 
 
287 aa  89  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.07 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.92 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.17 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  26.19 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.35 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.76 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.15 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.32 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.9 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  23.53 
 
 
307 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.9 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.32 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.07 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.67 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.94 
 
 
234 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.68 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.27 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  23.26 
 
 
297 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.93 
 
 
308 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>