More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3309 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  89.26 
 
 		 270 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  78.57 
 
 		 252 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  76.71 
 
 		 262 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  74.9 
 
 		 268 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  73.98 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  74.9 
 
 		 268 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  80.75 
 
 		 260 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  75.21 
 
 		 253 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  75.21 
 
 		 253 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  73.2 
 
 		 260 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  72.4 
 
 		 260 aa  362  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  72.18 
 
 		 257 aa  351  8e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  69.44 
 
 		 258 aa  350  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  66.26 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  70.8 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  70.8 
 
 		 256 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  69.46 
 
 		 266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  67.8 
 
 		 257 aa  324  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  41.25 
 
 		 568 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 606 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 		 610 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 		 610 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 		 571 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  39.27 
 
 		 558 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.75 
 
 		 594 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 606 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  41.63 
 
 		 573 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  41.63 
 
 		 573 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 585 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 		 623 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 563 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  38.4 
 
 		 619 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 619 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 		 593 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 619 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 572 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 629 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  42.15 
 
 		 567 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  37.6 
 
 		 563 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  40.24 
 
 		 575 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.08 
 
 		 552 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.58 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 		 572 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 		 568 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 		 568 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  39.43 
 
 		 575 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 567 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 567 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  37.86 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 		 535 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.58 
 
 		 536 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  34.32 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 377 aa  112  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 395 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  31.74 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 		 399 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  28.95 
 
 		 400 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.6 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.19 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  27.8 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.12 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.91 
 
 		 809 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.73 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>