More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2756 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  97.31 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  94.12 
 
 
268 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  93.73 
 
 
268 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  83.53 
 
 
257 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  79.13 
 
 
256 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  78.35 
 
 
256 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  74.3 
 
 
262 aa  374  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  76.6 
 
 
252 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  72.47 
 
 
258 aa  363  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  68.5 
 
 
259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  73.2 
 
 
258 aa  355  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  75.21 
 
 
270 aa  351  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  73.55 
 
 
260 aa  344  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  72.22 
 
 
266 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  66.53 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  69.66 
 
 
257 aa  330  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  70.21 
 
 
253 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  70.21 
 
 
253 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  40.08 
 
 
568 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
623 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  41.6 
 
 
619 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  40.55 
 
 
629 aa  184  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.57 
 
 
594 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  41.2 
 
 
619 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
610 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 
619 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
610 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  40.83 
 
 
571 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
606 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
606 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
572 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
585 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.91 
 
 
552 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  38.33 
 
 
563 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  39.75 
 
 
558 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
244 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
563 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 
568 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.52 
 
 
244 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
567 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
567 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.67 
 
 
567 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
572 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
568 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
573 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
593 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
573 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
575 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  40 
 
 
575 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 
244 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  38.31 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 
242 aa  142  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
535 aa  138  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 
536 aa  132  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
401 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  36.97 
 
 
389 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
377 aa  108  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
395 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  30.56 
 
 
400 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
386 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.4 
 
 
397 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
234 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
399 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.02 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
344 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.58 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  32.14 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
262 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.91 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.49 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  30.14 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.33 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.44 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
450 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.91 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
366 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
222 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.63 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.91 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  30.19 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6102  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.94 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>