More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0997 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 226 aa  471  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  39.57 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  39.04 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 		 242 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  40.53 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 		 242 aa  167  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  37.95 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.17 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  29.78 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5557  hypothetical protein  38.01 
 
 		 176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  33.19 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2681  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0123554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 345 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  29.22 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.72 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 353 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 344 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 355 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.98 
 
 		 809 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.37 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 448 aa  92.8  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.17 
 
 		 248 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  29.19 
 
 		 352 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.69 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 333 aa  92  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  27.85 
 
 		 388 aa  91.7  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  29.17 
 
 		 883 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 340 aa  91.7  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1357  hypothetical protein  27.85 
 
 		 388 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  29.86 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 340 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 385 aa  89.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.17 
 
 		 305 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.7 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 301 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  29.47 
 
 		 328 aa  89  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.49 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 340 aa  87  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.04 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  28.04 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.44 
 
 		 249 aa  85.9  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 		 349 aa  85.1  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.44 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.04 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.57 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 377 aa  82.4  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 450 aa  82.4  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  31.48 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.06 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  29.52 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>