More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1497 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  66.67 
 
 
262 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  68.05 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  66.14 
 
 
268 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  66.14 
 
 
268 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  66.53 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  66.13 
 
 
260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  67.65 
 
 
253 aa  333  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  67.65 
 
 
253 aa  333  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  65.46 
 
 
257 aa  332  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  64.85 
 
 
252 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  66.26 
 
 
258 aa  329  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  67.52 
 
 
270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  67.66 
 
 
260 aa  322  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  62.55 
 
 
258 aa  321  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  62.7 
 
 
256 aa  308  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  62.7 
 
 
256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  63.83 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  62.29 
 
 
257 aa  304  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.26 
 
 
552 aa  191  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
585 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 
606 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
606 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
623 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  39.59 
 
 
568 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
610 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
610 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
629 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
619 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  41.84 
 
 
619 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
619 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.59 
 
 
594 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
568 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 
567 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 
563 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
572 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
568 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 
567 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
572 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
593 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  39.75 
 
 
571 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.15 
 
 
567 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  39.75 
 
 
558 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  40.91 
 
 
575 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 
573 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 
573 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  40.5 
 
 
575 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  37.08 
 
 
563 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.49 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  38.93 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
256 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.76 
 
 
242 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.74 
 
 
536 aa  142  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.36 
 
 
535 aa  136  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  34.8 
 
 
389 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
377 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  28.95 
 
 
400 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
401 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
234 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.2 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
399 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.88 
 
 
397 aa  98.6  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
386 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  28.51 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.57 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.36 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2535  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
315 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
293 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.57 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
450 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
313 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.62 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
327 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
336 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  27.11 
 
 
291 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>