More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2808 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  99.25 
 
 		 268 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  93.73 
 
 		 260 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  92.94 
 
 		 260 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  81.96 
 
 		 257 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  80.31 
 
 		 256 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  79.53 
 
 		 256 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  73.49 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  75.85 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  74.9 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  72.06 
 
 		 258 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  68.9 
 
 		 259 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  75.21 
 
 		 270 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  73.14 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  66.14 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  70.51 
 
 		 266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  69.66 
 
 		 257 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  69.79 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  69.79 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  41.15 
 
 		 568 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 		 623 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.08 
 
 		 594 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 		 619 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  40.83 
 
 		 571 aa  178  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 		 619 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 		 629 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 		 610 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 		 610 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 		 606 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 		 619 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 606 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 		 572 aa  174  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 585 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  38.33 
 
 		 563 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 244 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 		 563 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 		 573 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 		 573 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.49 
 
 		 552 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.53 
 
 		 567 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  39.06 
 
 		 558 aa  168  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 568 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.93 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  40.23 
 
 		 575 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 		 567 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 		 593 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 		 568 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 		 572 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 567 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  39.38 
 
 		 575 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  36.48 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.48 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 536 aa  133  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.89 
 
 		 535 aa  132  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  34.32 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 395 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  28.06 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.41 
 
 		 397 aa  95.9  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 386 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 399 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.88 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 344 aa  86.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.58 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  32.59 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.09 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  44.83 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  30.62 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  51.39 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  30.92 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.59 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.03 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.27 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6102  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.72 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>