More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4447 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 364 aa  727    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  83.24 
 
 		 366 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  50.96 
 
 		 322 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  49.51 
 
 		 327 aa  325  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  48.36 
 
 		 336 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  49.84 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  50.48 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  49.84 
 
 		 330 aa  315  8e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  49.51 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  49.84 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  46.93 
 
 		 335 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  47.52 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  46.71 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.04 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  47.04 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  47.04 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  46.53 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.04 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  48.03 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  49.51 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  45.69 
 
 		 350 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 		 312 aa  292  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  44.15 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  44.74 
 
 		 310 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  45.25 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  46.2 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  46.2 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  43.19 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  47.51 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  44.16 
 
 		 321 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  47 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  45.39 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  45.39 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  44.48 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.33 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  45.31 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  43.46 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  46.71 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  46.49 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  43.05 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  45.07 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  43.04 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  46.77 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  41.61 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2952  glycosyl transferase family 2  48.92 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  42.72 
 
 		 319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  41.01 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.01 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  45.57 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  43.69 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  43.63 
 
 		 334 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  44.23 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  42.72 
 
 		 357 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  44.16 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  44.16 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  43.37 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  42.62 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  45.9 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  44.97 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  45.69 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  42.72 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  43.27 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  44.34 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  42.38 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  42.38 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  44.26 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  42.43 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  41.72 
 
 		 308 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  43.89 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  44.59 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  44.59 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  41.72 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 		 338 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  42.05 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  41.72 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  41 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.78 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.78 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.78 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  44.3 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  43.37 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 		 664 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  41.91 
 
 		 306 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  41.45 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 		 359 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  40.84 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4007  glycosyl transferase family protein  42.26 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848988  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  42.47 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  36.77 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>