240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3039 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3039  methyltransferase type 12  100 
 
 
578 aa  1185    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  38.07 
 
 
374 aa  213  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  37.03 
 
 
377 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
355 aa  203  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  47.56 
 
 
247 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
220 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
399 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
448 aa  98.6  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
395 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
230 aa  98.2  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  29.2 
 
 
389 aa  97.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
230 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
222 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
220 aa  91.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.22 
 
 
220 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
336 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.09 
 
 
247 aa  89.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
401 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
234 aa  87.4  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  27.68 
 
 
400 aa  87  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  30.91 
 
 
225 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
230 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
230 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
246 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
230 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
298 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.53 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3897  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
567 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20890  glycosyl transferase  32.26 
 
 
239 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
240 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
321 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
572 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1555  hypothetical protein  35.88 
 
 
148 aa  70.9  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
567 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
606 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0599  hypothetical membrane spanning protein  35.11 
 
 
148 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
571 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
228 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
229 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
228 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  27.63 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  26.81 
 
 
568 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
610 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
610 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
226 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
594 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  30.29 
 
 
273 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  25.99 
 
 
575 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.42 
 
 
242 aa  65.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  28.09 
 
 
291 aa  65.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
233 aa  66.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
619 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
629 aa  66.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  28.33 
 
 
567 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
593 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
575 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
623 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
619 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
606 aa  63.9  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
336 aa  63.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
308 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
619 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.19 
 
 
301 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
573 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.49 
 
 
270 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
573 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 
314 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
274 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
568 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
235 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
450 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
311 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
585 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4045  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 
249 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
568 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
552 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
245 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
227 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
237 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
256 aa  58.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  26.18 
 
 
558 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
252 aa  57  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
239 aa  57  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.18 
 
 
262 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  33.54 
 
 
260 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
291 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
299 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
227 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
260 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>