More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8285 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
694 aa  1348    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  69.05 
 
 
217 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1719  glycosyl transferase family 2  68.12 
 
 
256 aa  260  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530897  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  62.32 
 
 
226 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  60.73 
 
 
224 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  63.68 
 
 
459 aa  220  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  53.99 
 
 
218 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0984  hypothetical protein  42.33 
 
 
491 aa  207  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10550  dolichyl-phosphate sugar synthase  53.11 
 
 
210 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0345787  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0710  glycosyl transferase family protein  54.76 
 
 
239 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0724  glycosyl transferase family protein  54.76 
 
 
239 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0259046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0704  glycosyl transferase family protein  54.76 
 
 
218 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
252 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3562  hypothetical protein  39.06 
 
 
516 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0138235  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  37.62 
 
 
231 aa  122  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
242 aa  111  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
389 aa  110  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 
394 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.72 
 
 
382 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4901  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
229 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.447134  decreased coverage  0.000680692 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  40.51 
 
 
388 aa  96.3  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0306  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
265 aa  95.9  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
414 aa  94.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
394 aa  94  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
298 aa  93.2  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3288  hypothetical protein  33.94 
 
 
429 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.35 
 
 
264 aa  92.8  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
291 aa  90.5  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.79 
 
 
248 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.8 
 
 
246 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
285 aa  88.2  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  33.66 
 
 
412 aa  87  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
282 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
378 aa  87  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
411 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
420 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  44.34 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
238 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
221 aa  85.1  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
480 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
371 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3758  glycosyl transferase family 2  35.18 
 
 
237 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102205  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
226 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  45.28 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  32.67 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  26.92 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
246 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
303 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.91 
 
 
809 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  33.94 
 
 
261 aa  79  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3290  glycosyl transferase family 2  40.57 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.53 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
340 aa  77  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  33.78 
 
 
285 aa  77  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
273 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
271 aa  77  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
250 aa  76.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32 
 
 
410 aa  77  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
304 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
253 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
230 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  43.93 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.67 
 
 
247 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
559 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  31.56 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  30.16 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  27.4 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.56 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  31.34 
 
 
243 aa  73.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  27.95 
 
 
574 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
321 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
252 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
272 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
262 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  31.14 
 
 
320 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
586 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>