More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1719 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1719  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
256 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530897  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  72.64 
 
 
217 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  67.59 
 
 
694 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  60.36 
 
 
224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  63.21 
 
 
226 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  63.76 
 
 
459 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  55.4 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10550  dolichyl-phosphate sugar synthase  53.81 
 
 
210 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0345787  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0710  glycosyl transferase family protein  55.41 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0724  glycosyl transferase family protein  55.41 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0259046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0704  glycosyl transferase family protein  56.22 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  33.64 
 
 
231 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
394 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
242 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
430 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
386 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
389 aa  95.5  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
282 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.18 
 
 
382 aa  92.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
414 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
411 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
394 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
378 aa  88.6  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0306  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
480 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
414 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
371 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
420 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
241 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  32.74 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  30.49 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
559 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  31.84 
 
 
412 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3758  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102205  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  35.4 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  25.11 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02480  GPI anchor biosynthesis-related protein, putative  26.1 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.56 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.14 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  28.69 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.48 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  29.65 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4901  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.447134  decreased coverage  0.000680692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.78 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
568 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  28.64 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  30.22 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.36 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
343 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>