More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0979 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 226 aa  434  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  62.32 
 
 		 694 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  61.57 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  57.82 
 
 		 217 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1719  glycosyl transferase family 2  62.14 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  57.14 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10550  dolichyl-phosphate sugar synthase  54.5 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0345787  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  58.49 
 
 		 459 aa  194  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0704  glycosyl transferase family protein  60.77 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0710  glycosyl transferase family protein  60.77 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0724  glycosyl transferase family protein  60.77 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0259046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 		 394 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 430 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  36.41 
 
 		 412 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  31.46 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.61 
 
 		 382 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  34.63 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0306  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.6 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 480 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 331 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4901  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.447134  decreased coverage  0.000680692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3758  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 354 aa  71.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  42.98 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  31.76 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 559 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 317 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0422  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.93 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.39 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.12 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.53 
 
 		 310 aa  65.1  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.31 
 
 		 809 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  30 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.11 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>