More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3090 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
459 aa  870    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  63.68 
 
 
694 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  59.43 
 
 
217 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1719  glycosyl transferase family 2  62.86 
 
 
256 aa  223  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530897  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  58.96 
 
 
226 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  56.02 
 
 
224 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  50.7 
 
 
218 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10550  dolichyl-phosphate sugar synthase  50 
 
 
210 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0345787  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0710  glycosyl transferase family protein  54.34 
 
 
239 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237777  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0724  glycosyl transferase family protein  54.34 
 
 
239 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0259046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0704  glycosyl transferase family protein  54.34 
 
 
218 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  52.24 
 
 
222 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  52.94 
 
 
211 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  55.43 
 
 
222 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  44.64 
 
 
240 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  37.67 
 
 
252 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
394 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  32.23 
 
 
231 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
394 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 
242 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
480 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.82 
 
 
382 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  35.05 
 
 
199 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  41.45 
 
 
218 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 
430 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  32.28 
 
 
422 aa  89.7  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  37.38 
 
 
412 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
298 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  31.38 
 
 
203 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
227 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  29.74 
 
 
199 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  32.68 
 
 
224 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  40.57 
 
 
223 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  40.57 
 
 
223 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  33.97 
 
 
228 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  32.04 
 
 
227 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
229 aa  87.4  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  29.9 
 
 
207 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  33.17 
 
 
224 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
271 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  29.9 
 
 
207 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
559 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  41.98 
 
 
221 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  33.81 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  40.09 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  30.16 
 
 
201 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3758  glycosyl transferase family 2  37.77 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102205  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0306  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  36.84 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4901  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.447134  decreased coverage  0.000680692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
283 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  37.88 
 
 
207 aa  84  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
389 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
285 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  36.89 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
238 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 
301 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
299 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  33.04 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  37.16 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  32.29 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.63 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  39.53 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
287 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
282 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
254 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.19 
 
 
305 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
271 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
252 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  33.77 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  36.41 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
305 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
227 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
257 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.16 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  34.05 
 
 
194 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.26 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>