More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1173 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  843    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  44.78 
 
 
458 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  40.05 
 
 
441 aa  306  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  52.49 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  48.65 
 
 
226 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  50.68 
 
 
228 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  46.85 
 
 
226 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
435 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  45.91 
 
 
227 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  49.74 
 
 
201 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  46.31 
 
 
217 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  48.47 
 
 
207 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  48.47 
 
 
207 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  47.5 
 
 
216 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  45.73 
 
 
213 aa  176  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  40.72 
 
 
222 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  40.25 
 
 
242 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  39.56 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  43.01 
 
 
194 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
224 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  38.22 
 
 
228 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 
233 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 
251 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 
234 aa  143  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  41.23 
 
 
225 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.29 
 
 
264 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  41.33 
 
 
227 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  40.36 
 
 
236 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.06 
 
 
234 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  41.33 
 
 
226 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  35.58 
 
 
234 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  35.15 
 
 
227 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.62 
 
 
236 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  38.16 
 
 
231 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
235 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 
238 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  34.98 
 
 
246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  37.05 
 
 
228 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  36.89 
 
 
229 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  36.87 
 
 
231 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
244 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  34.83 
 
 
202 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  34.16 
 
 
228 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  43.08 
 
 
203 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  40.61 
 
 
217 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  38.5 
 
 
229 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.5 
 
 
227 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  37.12 
 
 
234 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.56 
 
 
229 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  34.38 
 
 
212 aa  116  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  35.03 
 
 
228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  34.03 
 
 
203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
227 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
227 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  33.51 
 
 
199 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 
242 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
244 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  36.76 
 
 
205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  33.16 
 
 
227 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  36.11 
 
 
244 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  36.6 
 
 
214 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  32.02 
 
 
230 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  35.32 
 
 
241 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  35.2 
 
 
285 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  34.54 
 
 
207 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  38.33 
 
 
216 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  34.06 
 
 
224 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  35.9 
 
 
207 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
375 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
226 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  36.36 
 
 
220 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  34.95 
 
 
254 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  32.5 
 
 
245 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  35.81 
 
 
231 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  36.71 
 
 
205 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
376 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  32.2 
 
 
259 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  34.31 
 
 
239 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  33.01 
 
 
243 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  31.47 
 
 
220 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
247 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
345 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  31.51 
 
 
243 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  34.18 
 
 
224 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  33.65 
 
 
233 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
230 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  33.83 
 
 
568 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  34.5 
 
 
192 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.27 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
227 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  33 
 
 
218 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  35.38 
 
 
213 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  34.87 
 
 
243 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  34.78 
 
 
207 aa  96.7  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  31.5 
 
 
204 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  36.14 
 
 
204 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>