67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8284 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  56.94 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  53.33 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  53.59 
 
 		 459 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  48.54 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  44.5 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  44.08 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  44.08 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  44.08 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  42.47 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  34.27 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2754  hypothetical protein  48.21 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0313072  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  41.06 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  32.98 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  34.03 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  31 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  32.82 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  34.54 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  36.36 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  29.84 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  31.55 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  28.06 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  29.59 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  31.28 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  31.44 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  31.79 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  34.18 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  32.14 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  32.83 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  36.98 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  33.97 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  25.98 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  39.72 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  20 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  28.17 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  31.34 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  29.25 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  28.99 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  34.18 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  26.7 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  23.23 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  23.23 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  29.23 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47585  predicted protein  28.63 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  33.84 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 458 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  30.99 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  30.15 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  29.52 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  26.53 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  26.53 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  32.83 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  30.91 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  28.92 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  30.2 
 
 		 290 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  33.79 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 441 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  26.63 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  26.29 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  25.64 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  31.12 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  22.97 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>