80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05025 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  43.68 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  43.43 
 
 
203 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  39.9 
 
 
435 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  39.9 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  41.36 
 
 
199 aa  162  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  42.71 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  36.84 
 
 
207 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  36.84 
 
 
207 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  33.68 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  34.18 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  34.55 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  36.5 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  34.38 
 
 
422 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  33.16 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  32.65 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  32.5 
 
 
245 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  33.82 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  33.81 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
458 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  32.8 
 
 
224 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  31.58 
 
 
220 aa  101  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  31.38 
 
 
197 aa  101  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  34.54 
 
 
213 aa  101  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  29.76 
 
 
207 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  30.21 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  30.65 
 
 
207 aa  99  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  31.75 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  30.16 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  30.37 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  28.24 
 
 
220 aa  94.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  30.77 
 
 
214 aa  94.7  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  32.16 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  30.77 
 
 
217 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  30.93 
 
 
203 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  28.87 
 
 
568 aa  91.3  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  32.77 
 
 
203 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  31.44 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  27.05 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  28.57 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  29.33 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  28.23 
 
 
243 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  32.12 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  27.98 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  29.91 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
441 aa  85.1  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  29.29 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  31.49 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  29.9 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  32.81 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06281  hypothetical protein  28.11 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0473022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  27.8 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  25.98 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  26.47 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  29.5 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  28.7 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  27.06 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  33.06 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  29.41 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  34.65 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  28.4 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  28.28 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  28.28 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  28.28 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  31.19 
 
 
243 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31542  predicted protein  21.08 
 
 
272 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.348299  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  28.85 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  24.71 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  24.19 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  27.5 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
459 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  37.29 
 
 
290 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  28.47 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2637  hypothetical protein  41.3 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.532364  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  26.29 
 
 
222 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>