78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1770 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  59.18 
 
 
231 aa  247  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  58.76 
 
 
435 aa  224  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  55.1 
 
 
203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  51.56 
 
 
199 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  48.95 
 
 
199 aa  185  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  43.68 
 
 
212 aa  182  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  37.13 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  35.32 
 
 
216 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  37.89 
 
 
207 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  37.89 
 
 
207 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  34.83 
 
 
422 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
458 aa  121  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  35.38 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  35.6 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  34.39 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  36.51 
 
 
205 aa  111  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  35.86 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  32.16 
 
 
241 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  34.01 
 
 
216 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  30.92 
 
 
254 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  35.05 
 
 
568 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  34.55 
 
 
214 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  32.47 
 
 
239 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  32.99 
 
 
224 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  26.77 
 
 
243 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  31.61 
 
 
244 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  35.75 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  30.46 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
441 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  37.44 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  32.49 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  31.84 
 
 
207 aa  92  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  36.65 
 
 
219 aa  92  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  32.65 
 
 
192 aa  91.7  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  32.99 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  33.51 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  28.65 
 
 
203 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  31.22 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  29.72 
 
 
243 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  32.1 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  30.77 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  32.64 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  28.1 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  25.65 
 
 
219 aa  82  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  27.32 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  32.68 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  31.96 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06281  hypothetical protein  29.44 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0473022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  30.16 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  28.95 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  28.02 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  29.76 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  26.96 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  27.54 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  26.34 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  31.61 
 
 
207 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  36.92 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  32.77 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  28.95 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  29.69 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  29.32 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  28.72 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  29.79 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  26.92 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  26.73 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  26.73 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
459 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  25.89 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  31.09 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  31.85 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  26.32 
 
 
270 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  25.52 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0925  hypothetical protein  25.7 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>