22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0925 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0925  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  530  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1892  hypothetical protein  47.27 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0918  hypothetical protein  45.56 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  31.46 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  28.37 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  27.91 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  20.88 
 
 
219 aa  55.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
458 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  26.55 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  25.68 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  29.2 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  26.01 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  26.26 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  24.77 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  26.17 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  24.77 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  24.09 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  25.7 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  24.54 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  22.62 
 
 
422 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  25.6 
 
 
224 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  25.45 
 
 
199 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>