82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0485 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  60.43 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  48.15 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  48.61 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  39 
 
 		 285 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  44.5 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  42.27 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  37.95 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  38.43 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  37.56 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  36.06 
 
 		 435 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  41.36 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  43.06 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  36.5 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 		 458 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  35.08 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  35.86 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  35.08 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  36.22 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  39.8 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  32.5 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  35.29 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  35.86 
 
 		 202 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  36.23 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  34.9 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  39.9 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  32.5 
 
 		 422 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  33.99 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  35.75 
 
 		 568 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  32.37 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  32.02 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  32.26 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  34.47 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  34.63 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  38.43 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  27.55 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  31.84 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  34.48 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  36.98 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  36 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  34.69 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  32.12 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  34.72 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  36.82 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  38.22 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  38.16 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  32.12 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  32.32 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  34.98 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  35.05 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  33.53 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  32.29 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  29.95 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  30.33 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  31.75 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  24.02 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47585  predicted protein  28 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0925  hypothetical protein  28.37 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  29.75 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  35.05 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 459 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  24.29 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  28.99 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  24.29 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  24.37 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  24.59 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06281  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0473022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2637  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.532364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2754  hypothetical protein  34.03 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0313072  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31542  predicted protein  25.81 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.348299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  29.27 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  29.27 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  29.27 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>