68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0564 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  88.67 
 
 
203 aa  367  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  87.13 
 
 
203 aa  337  5e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06281  hypothetical protein  67.2 
 
 
217 aa  265  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0473022  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  45.27 
 
 
243 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  44.06 
 
 
243 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  37.81 
 
 
220 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  43.07 
 
 
233 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  157  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  34.62 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  34.21 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  33.16 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  31.44 
 
 
212 aa  91.3  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  30.57 
 
 
422 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  31.09 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  34.45 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  31.19 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  26.13 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  30.93 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  27.32 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  26.9 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
435 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  25.74 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  29.38 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 
458 aa  72.4  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  26.9 
 
 
192 aa  72  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  26.13 
 
 
568 aa  71.6  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  27.64 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  26.64 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  29.56 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  29.56 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  26 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  27.23 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  25.25 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  27.91 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  29 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  28.64 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  28.71 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  24.26 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  25 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  23.83 
 
 
254 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  26.83 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  26.26 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  25.51 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  24.15 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  27.32 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  30.4 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  22.68 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  23.98 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  24.37 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  23.88 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  23.83 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  25.13 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  23.83 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  28.24 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  25.77 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  26 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  27.18 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  21.21 
 
 
203 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  22.11 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  26.26 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  26.26 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  21.39 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  33.67 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  20.2 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>