70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2219 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  100 
 
 
218 aa  453  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  36.27 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  37.63 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  34.65 
 
 
199 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  35.96 
 
 
207 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  35.71 
 
 
228 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  33 
 
 
422 aa  99.4  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  35.35 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  31 
 
 
216 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  33.17 
 
 
201 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  34.54 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  34.54 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  34.85 
 
 
224 aa  94.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  34.63 
 
 
245 aa  92.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  32.31 
 
 
197 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  32.18 
 
 
231 aa  92  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  33.51 
 
 
205 aa  89  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
458 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  33.16 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  31.84 
 
 
199 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  29.95 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  28.93 
 
 
205 aa  85.1  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  30.77 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  30.05 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  31.03 
 
 
207 aa  82  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  30.1 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  27.86 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  38.02 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  36.75 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  27.8 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  28.08 
 
 
214 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  31.16 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  35.54 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  31 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  27 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  30.96 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  31.94 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  29.17 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  28.57 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  27.18 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  26.04 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  29.9 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  29.06 
 
 
568 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  28.14 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  25.73 
 
 
243 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  26.5 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  27.75 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  26.67 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  29.48 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  37.36 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  23.62 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  35.64 
 
 
243 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  24.88 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
441 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  32.26 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
459 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  24.19 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  26.19 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  24.66 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  30.39 
 
 
243 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  26.53 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  24.09 
 
 
243 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  25.13 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  34.17 
 
 
192 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47585  predicted protein  22.91 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  33.67 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  25.64 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  25.52 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  30.61 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>