80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3073 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  60.43 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  55.45 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  49.32 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  48.66 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  42.13 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  40 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  39.2 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  39.29 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  41.84 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 		 435 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  37.55 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  40.21 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  37.25 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  36.73 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  37.06 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  35.35 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  36.41 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  39.09 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  34.55 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  40 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  35.03 
 
 		 422 aa  115  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  35.23 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  35.23 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  35.32 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  36.79 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  35.44 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  35.03 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  29.19 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  35.71 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  33.67 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 458 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  35.71 
 
 		 568 aa  95.9  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  35.27 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 441 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  38.07 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  36.14 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  34.83 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  38.02 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  39.6 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  32.81 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  36.14 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  30.65 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  33.51 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  35.56 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  36.13 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  36.36 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  33.99 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  29.02 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  36 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  26.61 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  34.67 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  34.27 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  31.09 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  38.3 
 
 		 211 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  30.73 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  31.77 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  31.77 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  30.19 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  33.99 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  28.64 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47585  predicted protein  27.19 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  26.09 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  27.87 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  29.23 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  29.76 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31542  predicted protein  29.17 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.348299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0925  hypothetical protein  27.91 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  29.23 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  27.32 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  25.48 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  26.34 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06281  hypothetical protein  28.06 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0473022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  26.47 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  28.28 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  28.28 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  28.28 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0918  hypothetical protein  23.39 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>