27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0918 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0918  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1892  hypothetical protein  53.6 
 
 
281 aa  307  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0925  hypothetical protein  46.36 
 
 
259 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  23.9 
 
 
422 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  26.11 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  26.11 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  23.64 
 
 
204 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  26.79 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  25 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  26.87 
 
 
216 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  23.62 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  25.7 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  26.59 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  22.58 
 
 
227 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  24.31 
 
 
201 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  26.61 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  22.55 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  26.73 
 
 
194 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  25.99 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  24.42 
 
 
220 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  24.12 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  25 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0185  hypothetical protein  29.77 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  24.66 
 
 
219 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  28.74 
 
 
218 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  25.23 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  21.99 
 
 
213 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>