73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04160 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  29.41 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  31.54 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  32.77 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  26.81 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  30.67 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  32.52 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  28.1 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  26.19 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  28 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  35.11 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  32.77 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  32.77 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  31.67 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  28.69 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  29.41 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 441 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  32.46 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  29.49 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  29.75 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  30.89 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  26.21 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  27.87 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  27.87 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  30.47 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  30.47 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  26.81 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  30.25 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  32.28 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  27.45 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  26.19 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  33.08 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  23.91 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  27.03 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  28.33 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  25.88 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  39.44 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  27.05 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  29.77 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  30.36 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  25.52 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  28.23 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  35.11 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  32.26 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  29.37 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  31.13 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  27.45 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  26.45 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  30.25 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  29.27 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  26.09 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  25.37 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06281  hypothetical protein  34.78 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0473022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  35.71 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  30.36 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  28.46 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  26.61 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  26.21 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  41.3 
 
 		 207 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>