80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2980 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  46.07 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  45.03 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  41.12 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  44.5 
 
 		 245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  44.04 
 
 		 239 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  38.16 
 
 		 244 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  39.38 
 
 		 285 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  41.84 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  40.31 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  34.96 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  36.51 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  36.51 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  37.13 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  34.98 
 
 		 254 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 435 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3984  hypothetical protein  34.36 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000945998 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  33.5 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  37.04 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  36.63 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  36.1 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  39.78 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  35.86 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  38.33 
 
 		 422 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  36.55 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  34.01 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 458 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  31.94 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  35.89 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  33.16 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  33.68 
 
 		 568 aa  95.5  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  35.21 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  30.81 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  35.43 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  36.06 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  35.87 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  35.16 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  33.7 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  35.15 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  34.36 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 441 aa  82  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  36.87 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  33.82 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  31.47 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1419  hypothetical protein  32.98 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  34.97 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1776  hypothetical protein  29.74 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  34.16 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20690  hypothetical protein  29.63 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  28 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  29.44 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  34.54 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  34.57 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2219  L-aspartate oxidase  29.9 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.362155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  30.58 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  26.67 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  22.79 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  23.88 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 459 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  35.55 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  36.46 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  26.96 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  26.96 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  31.08 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  35.4 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  32.29 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  28.27 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  27.87 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  35.48 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  27.73 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47585  predicted protein  24.76 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06281  hypothetical protein  25.82 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0473022  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31542  predicted protein  27.45 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.348299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>