77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2754 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2754  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0313072  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  51.21 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  51.21 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  51.21 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  46.3 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  47.6 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  48.74 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  46.33 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  43.42 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  43.18 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  42.59 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  44.23 
 
 		 459 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  36.41 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  30.93 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  31.34 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  35.68 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  34 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  37.88 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  36.89 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  32.65 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  35.68 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  36.62 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  28.12 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  26.96 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  32.99 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  38.54 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0192  hypothetical protein  34.23 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  29.5 
 
 		 422 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  36.27 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  27.32 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  29.7 
 
 		 568 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  33.8 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  36.1 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 441 aa  58.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  27.72 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  35.75 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  31.03 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  30.85 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  27.69 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  26.9 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04160  hypothetical protein  29.75 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.413339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  34.38 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  27.56 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  25.68 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  26.57 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  31.98 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  33.17 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  24.04 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  29.08 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  20.62 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0564  hypothetical protein  21.65 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0971  hypothetical protein  29.86 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.341822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  29.59 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  34.31 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  33.5 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06201  hypothetical protein  21.13 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.567891  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0884  hypothetical protein  30.52 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.585528  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05671  hypothetical protein  24.15 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.372375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 348 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1894  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  28.37 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06191  hypothetical protein  24.67 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.690351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  23.35 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  26.42 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  23.35 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.72 
 
 		 348 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  32.35 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.72 
 
 		 374 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  27.72 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.72 
 
 		 374 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  27.72 
 
 		 374 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.72 
 
 		 408 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.51 
 
 		 348 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>