More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0447 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  82.95 
 
 
301 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  58.73 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  57.69 
 
 
276 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  59.83 
 
 
287 aa  269  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  58.72 
 
 
285 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  56.47 
 
 
282 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  51.6 
 
 
266 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 
257 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  47.54 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  48.02 
 
 
283 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  44.96 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  44.87 
 
 
410 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  43.35 
 
 
410 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
394 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
298 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
303 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
414 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  31.36 
 
 
309 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
227 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
420 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
346 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
227 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
238 aa  99.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
319 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  29.15 
 
 
305 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
430 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
246 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  32.1 
 
 
322 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.22 
 
 
248 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.59 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
411 aa  92.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.43 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  31.44 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
393 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
304 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  32.14 
 
 
883 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  29.54 
 
 
236 aa  89  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
476 aa  89  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
236 aa  88.6  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.8 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  31.74 
 
 
239 aa  88.6  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.36 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  33.78 
 
 
243 aa  87  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  27.62 
 
 
238 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.43 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.6 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
238 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  41.29 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  32.68 
 
 
231 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  30.94 
 
 
874 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
346 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
472 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2295  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  30.87 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.57 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.3 
 
 
809 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3418  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.46 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187526  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.67 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
586 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  31.36 
 
 
406 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  33.18 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  33.33 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.83 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>