17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3288 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3288  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  816    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4899  hypothetical protein  74.88 
 
 		 445 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000628718  decreased coverage  0.000930566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0984  hypothetical protein  40.08 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 		 694 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1568  hypothetical protein  37.9 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0338  hypothetical protein  41.12 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246873  normal  0.679867 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3562  hypothetical protein  37.36 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0138235  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05415  hypothetical protein  26.34 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.671814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  30.62 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0296  hypothetical protein  28.7 
 
 		 520 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  28.57 
 
 		 522 aa  51.2  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  30.77 
 
 		 539 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  30.61 
 
 		 519 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  30.85 
 
 		 518 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0390  hypothetical protein  36.92 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  30.35 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  28.79 
 
 		 516 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>