46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0380 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  987    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  36.86 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  34.66 
 
 		 516 aa  174  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  31.24 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  33.09 
 
 		 579 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  33.09 
 
 		 579 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  32.67 
 
 		 579 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  33.59 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  32.79 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  34.49 
 
 		 594 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  34.26 
 
 		 563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  36.81 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  36.87 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  31.93 
 
 		 557 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  35.48 
 
 		 527 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  32.98 
 
 		 546 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  32.08 
 
 		 591 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  32.05 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  29.98 
 
 		 551 aa  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  34.46 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.97 
 
 		 519 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  31.33 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  32.23 
 
 		 490 aa  130  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  29.83 
 
 		 505 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  31.79 
 
 		 607 aa  123  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  34.91 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  34.91 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  34.91 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  31.91 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  35.29 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  40.22 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  36.36 
 
 		 529 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  34.02 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  35.19 
 
 		 592 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  42.86 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  30.12 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  40 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  24.22 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  35.11 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  32.52 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1899  hypothetical protein  24.88 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0390  hypothetical protein  28.9 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  27.95 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  30.67 
 
 		 551 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  24.1 
 
 		 517 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>