43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0074 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  100 
 
 
563 aa  1112    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  50.9 
 
 
518 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  51.65 
 
 
508 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  43.8 
 
 
551 aa  395  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  37.5 
 
 
575 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  31.59 
 
 
551 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  32.46 
 
 
516 aa  156  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  33.48 
 
 
486 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  30.06 
 
 
579 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  29.85 
 
 
579 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  29.85 
 
 
579 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  30.66 
 
 
572 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  33.68 
 
 
557 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  31.28 
 
 
490 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  30.22 
 
 
546 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  32.04 
 
 
516 aa  143  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  34.94 
 
 
529 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  34.96 
 
 
527 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  27.64 
 
 
591 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  30.23 
 
 
505 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  29.23 
 
 
510 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  29.23 
 
 
510 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  29.23 
 
 
510 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  29.25 
 
 
543 aa  134  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  34.26 
 
 
522 aa  127  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  27.18 
 
 
594 aa  127  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.44 
 
 
519 aa  127  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  29.42 
 
 
539 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  38.22 
 
 
498 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  37.7 
 
 
527 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  30.38 
 
 
607 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  32.73 
 
 
522 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  34.66 
 
 
472 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  33.7 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  30.77 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  28.5 
 
 
509 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  25.7 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  34.21 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  30.77 
 
 
592 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1899  hypothetical protein  24.51 
 
 
468 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  35.48 
 
 
632 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  29.95 
 
 
477 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  29.22 
 
 
519 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>