42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11487 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  72.24 
 
 		 579 aa  802    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  72.24 
 
 		 579 aa  802    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  74.87 
 
 		 572 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  72.41 
 
 		 579 aa  804    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  100 
 
 		 591 aa  1140    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  73.97 
 
 		 551 aa  816    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  48.18 
 
 		 594 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  49.81 
 
 		 607 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  41.46 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  45.33 
 
 		 527 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  37.57 
 
 		 516 aa  287  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  38.04 
 
 		 557 aa  259  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  38.93 
 
 		 539 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  31.41 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  28.85 
 
 		 518 aa  173  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  38.22 
 
 		 529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  28.2 
 
 		 508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  30.47 
 
 		 551 aa  163  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  37.35 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  29.06 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  41.3 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  37.4 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  37.4 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  37.4 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  32.08 
 
 		 575 aa  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  30.92 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  39 
 
 		 546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  32.32 
 
 		 498 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  42.63 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  35.91 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  43.09 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  30.79 
 
 		 509 aa  100  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  38.33 
 
 		 500 aa  97.4  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  37.5 
 
 		 495 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  29.53 
 
 		 472 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  38.37 
 
 		 522 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  31.53 
 
 		 592 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  30.63 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  36.18 
 
 		 632 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  32.72 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  26.28 
 
 		 517 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  32.58 
 
 		 473 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>