41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2434 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1119    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1119    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  84.97 
 
 		 572 aa  864    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  99.48 
 
 		 579 aa  1113    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  84.26 
 
 		 551 aa  876    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  72.24 
 
 		 591 aa  769    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  51.71 
 
 		 594 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  49.39 
 
 		 607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  43.08 
 
 		 543 aa  362  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  45.42 
 
 		 527 aa  339  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  38.96 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  42.14 
 
 		 539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  38.28 
 
 		 557 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  32.97 
 
 		 529 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  31.84 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  33.12 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  30.72 
 
 		 551 aa  174  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  31.53 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  31.53 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  31.53 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  29.61 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  29.73 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.21 
 
 		 505 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  31.36 
 
 		 486 aa  158  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  29.85 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  35.03 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  32.71 
 
 		 575 aa  146  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  27.68 
 
 		 546 aa  145  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  34.51 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  33.09 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  43.6 
 
 		 490 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  32.02 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  35.16 
 
 		 472 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  32.75 
 
 		 495 aa  97.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  37.95 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  30.16 
 
 		 522 aa  93.6  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  30.88 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  29.05 
 
 		 592 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  36.36 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  32.35 
 
 		 519 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  32.87 
 
 		 551 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>