38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3578 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  51.72 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  51.1 
 
 		 495 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  40.72 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  38.87 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  36.48 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  37.92 
 
 		 527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  36.54 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  36.54 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  36.54 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  32.58 
 
 		 543 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  33.78 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  33.78 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  33.78 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  33.06 
 
 		 551 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  33.01 
 
 		 516 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  40.44 
 
 		 486 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  37.06 
 
 		 557 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  34.24 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  31.91 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  39.02 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  35.73 
 
 		 572 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  33.18 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  32.18 
 
 		 594 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  33.11 
 
 		 551 aa  140  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  34.38 
 
 		 563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  30.68 
 
 		 591 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  34.33 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  36.41 
 
 		 527 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  33.51 
 
 		 607 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  34.71 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  36.19 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  34.28 
 
 		 539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  41.76 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  34.48 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  34.12 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  32.8 
 
 		 592 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  41.49 
 
 		 632 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>