41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2731 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  72.71 
 
 
591 aa  784    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  81.14 
 
 
579 aa  908    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  88.61 
 
 
551 aa  953    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  81.49 
 
 
579 aa  911    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  100 
 
 
572 aa  1104    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  81.14 
 
 
579 aa  908    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  52.13 
 
 
594 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  51.37 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  44.64 
 
 
543 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  46.6 
 
 
527 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  40.21 
 
 
516 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  40.1 
 
 
557 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  40.3 
 
 
539 aa  249  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  32.47 
 
 
529 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  32.38 
 
 
527 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  31.12 
 
 
551 aa  182  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  32.26 
 
 
516 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  31.02 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  31.35 
 
 
510 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  31.35 
 
 
510 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  31.35 
 
 
510 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  30.02 
 
 
508 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  30.47 
 
 
563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  34.17 
 
 
486 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.84 
 
 
505 aa  163  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  33.69 
 
 
575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  35.56 
 
 
498 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  29.58 
 
 
546 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.31 
 
 
519 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  33.61 
 
 
522 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  43.09 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  32.18 
 
 
509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  34.28 
 
 
472 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  32.6 
 
 
495 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  37.5 
 
 
500 aa  95.1  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  30.25 
 
 
522 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  27.61 
 
 
592 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  34.12 
 
 
529 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  33.33 
 
 
519 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  31.58 
 
 
632 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  32.17 
 
 
551 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>