28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4117 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  987    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  37.67 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  40.19 
 
 		 551 aa  150  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  35.57 
 
 		 473 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  38.67 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  38.19 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  31.85 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  31.64 
 
 		 551 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  32.77 
 
 		 591 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  30.73 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 527 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  32.89 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  32.45 
 
 		 579 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  32.45 
 
 		 579 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  25.9 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  31.14 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  31.79 
 
 		 579 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  32.24 
 
 		 516 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  29.1 
 
 		 607 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0390  hypothetical protein  29.73 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  24.72 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  26.8 
 
 		 563 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  30.52 
 
 		 498 aa  47.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  30.4 
 
 		 509 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  30.52 
 
 		 592 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  34.25 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 694 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>