34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0171 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  854    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  38.94 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  45.49 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  42.72 
 
 		 551 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  34.25 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  33.94 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  36.14 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  33.74 
 
 		 551 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  26.47 
 
 		 517 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  33.51 
 
 		 516 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  37.11 
 
 		 509 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  31.93 
 
 		 579 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  27.54 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  31.93 
 
 		 579 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  32.61 
 
 		 591 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  26.79 
 
 		 477 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  32.61 
 
 		 572 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  35.96 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  31.33 
 
 		 579 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  33.5 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  31.82 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  31.82 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  31.82 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  34.9 
 
 		 557 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0390  hypothetical protein  26.22 
 
 		 485 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  30.88 
 
 		 594 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  40.7 
 
 		 529 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  33.83 
 
 		 592 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  33.15 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  31.84 
 
 		 575 aa  44.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  31.68 
 
 		 527 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  33.17 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  30.63 
 
 		 607 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 529 aa  43.1  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>