27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0321 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0321  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1026    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01971  hypothetical protein  34.83 
 
 
523 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1491  hypothetical protein  34.08 
 
 
523 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2368  hypothetical protein  40.94 
 
 
531 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14251  glycosyltransferase  34.61 
 
 
533 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26361  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  40.12 
 
 
546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.874739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0648  family 39 glycosyl transferase  33.54 
 
 
515 aa  171  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  30.07 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  30.07 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
564 aa  163  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1297  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
515 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1445  glycosyl transferase family 39  30.82 
 
 
599 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3121  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
539 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  28.51 
 
 
536 aa  139  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4820  glycosyl transferase family 39  31.65 
 
 
528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3228  glycosyl transferase family 39  25.06 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2892  glycosyl transferase family 39  25.06 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.220651  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
553 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  26.68 
 
 
554 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  25.67 
 
 
575 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.12 
 
 
553 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  23.76 
 
 
553 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.12 
 
 
556 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
557 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.24 
 
 
546 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  27.65 
 
 
515 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
564 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>