45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2915 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  991    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  30.25 
 
 		 516 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  31.03 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  34.47 
 
 		 539 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  29.95 
 
 		 516 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  30.88 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  31.34 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  31.34 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  31.34 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  30.62 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  30.02 
 
 		 546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  29.51 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  29.64 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  29.64 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  29.64 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  31.25 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  31.32 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  28.39 
 
 		 563 aa  110  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  30.67 
 
 		 557 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  30.71 
 
 		 572 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  29.24 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  29.34 
 
 		 543 aa  105  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  35.44 
 
 		 527 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  28.04 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  26.75 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  25.3 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  27.12 
 
 		 551 aa  100  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  29.7 
 
 		 607 aa  90.1  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  27.99 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  36.24 
 
 		 591 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  28.12 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  32.19 
 
 		 592 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  33.03 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  30.82 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  32.8 
 
 		 509 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  30.16 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  41.41 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  38.22 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  26.03 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  28.48 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  30.3 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  30.28 
 
 		 551 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  27.32 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  28.67 
 
 		 492 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>