42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2434 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1021    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  81.49 
 
 		 508 aa  808    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  50.7 
 
 		 563 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  44.25 
 
 		 551 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  35.77 
 
 		 575 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  31.11 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  33.71 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  29.94 
 
 		 579 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  29.73 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  29.73 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  32.26 
 
 		 543 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  33.26 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  31.02 
 
 		 572 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  32.92 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  28.49 
 
 		 591 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  31.07 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  31.26 
 
 		 529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  32.46 
 
 		 557 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  31.24 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  28 
 
 		 594 aa  144  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  29.5 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  35.32 
 
 		 498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  29.1 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  31.12 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  31.12 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  31.12 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  30.45 
 
 		 527 aa  133  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  31.38 
 
 		 546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  27.6 
 
 		 505 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.25 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  29.4 
 
 		 607 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  30.56 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  29.86 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  31.69 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  24.77 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  30.45 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  31.1 
 
 		 592 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  29.56 
 
 		 529 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  23.7 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  37.5 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1899  hypothetical protein  27.65 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  26.39 
 
 		 551 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>