16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1899 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1899  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  929    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  30 
 
 
477 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0390  hypothetical protein  25.62 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  26.79 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  31.36 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  24.51 
 
 
563 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  27.36 
 
 
498 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  23.24 
 
 
551 aa  57.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  24.42 
 
 
516 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  27.65 
 
 
518 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  26.14 
 
 
486 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  24.88 
 
 
522 aa  53.9  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  21.73 
 
 
516 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  27.46 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  26.2 
 
 
508 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  28.08 
 
 
543 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>