44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12202 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  100 
 
 		 516 aa  1003    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  71.52 
 
 		 510 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  71.52 
 
 		 510 aa  663    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  69.07 
 
 		 529 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  71.52 
 
 		 510 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  70.52 
 
 		 527 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  54.3 
 
 		 519 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  41.95 
 
 		 505 aa  352  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  44.35 
 
 		 486 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  36.86 
 
 		 546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  35.5 
 
 		 543 aa  203  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  34.49 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  32.5 
 
 		 551 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  32.62 
 
 		 579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  32.43 
 
 		 579 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  32.43 
 
 		 579 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  34.84 
 
 		 498 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  31.65 
 
 		 572 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  33.49 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  31.54 
 
 		 591 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 557 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  35.58 
 
 		 539 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  32.59 
 
 		 563 aa  156  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  31.07 
 
 		 518 aa  154  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  32.4 
 
 		 607 aa  153  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  30.14 
 
 		 594 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  30.66 
 
 		 508 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  29.89 
 
 		 490 aa  144  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  37.24 
 
 		 575 aa  140  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  27.97 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  31.76 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  31.59 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  31.44 
 
 		 509 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  33.75 
 
 		 522 aa  97.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  34.33 
 
 		 529 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  27.58 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  35.29 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  33.64 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1899  hypothetical protein  21.93 
 
 		 468 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  31.13 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  26.83 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  23.6 
 
 		 477 aa  47.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  27.16 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05415  hypothetical protein  22.78 
 
 		 461 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.671814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>