42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3679 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  84.26 
 
 		 579 aa  877    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  84.26 
 
 		 579 aa  877    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  91.06 
 
 		 572 aa  914    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  73.97 
 
 		 591 aa  786    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  82.03 
 
 		 579 aa  881    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1064    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  52.5 
 
 		 594 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  47.7 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  44.34 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  47.38 
 
 		 527 aa  360  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  39.84 
 
 		 516 aa  303  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  40.1 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  41.9 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  34.5 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  32.82 
 
 		 529 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  30.19 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  32.18 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  30.88 
 
 		 510 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  30.88 
 
 		 510 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  30.88 
 
 		 510 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  31.12 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  31.11 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  31.59 
 
 		 563 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.35 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  35.29 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  32.12 
 
 		 490 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  33.48 
 
 		 575 aa  148  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  30.16 
 
 		 546 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  34.76 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.02 
 
 		 519 aa  144  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  33.59 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  32.2 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  33.58 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  38.39 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  31.65 
 
 		 495 aa  94.7  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  32.13 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  30.41 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  29.41 
 
 		 592 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  31.48 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  31.58 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  32.17 
 
 		 551 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  32.58 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>